Институт создан в 2000 году и на текущий момент, по численности персонала, является одним из крупнейших корпоративных проектных и научных организаций компании «Роснефть».
В 2022 году команда «СамараНИПИнефти» стала победителем фестиваля Всероссийского физкультурно-спортивного комплекса «Готов к труду и обороне» (ГТО) среди трудовых коллективов Самарской области.